五世紀時，該教一部分教徒在瑪茲達克的領導下，進行瞭一場社會和宗教改革。四百九十一到五百二十九年之間，在波斯和阿塞拜疆等地掀起瞭大規模的、持續不斷的起義。薩珊王朝先後采取欺騙與高壓的政策，起義終於被鎮壓。
公元前四世紀，希臘亞歷山大大帝征服波斯後，波斯進入希臘化時期，瑣羅亞斯德教受到沉重打擊，但在公元元年前後又重新活動，在波斯萬神殿中出現瞭希臘和波斯的混合神祇，阿胡拉·馬茲達及其僚神成瞭太陽神、月神等的夥伴，在羅馬統治時期，瑣羅亞斯德教諸神之一密特拉神（太陽神）成為地中海地區普遍信仰的對象。
公元六世紀薩珊王朝亡於穆斯林，起初哈裡發對瑣羅亞斯德教徒表示寬容，在依法納稅後容許其保持自己的信仰；諾幹年後強迫瑣羅亞斯德教教徒改信伊斯蘭教，殘留在波斯本土的該教教徒，被稱為迦巴爾（異教徒），部分通過西域進入中國，使該教在南北朝和隋唐時期盛行於西域。
很多人錯誤地把瑣羅亞斯德教與摩尼教、拜火教混為一談，實際這三者同源但教義不同甚至略有沖突。就如同猶太教、基督教和天主教的關系。據二十世紀七十年代統計，約有一點七萬人分佈在伊朗南部的耶斯德和格爾孟等地；另一部分教徒從八世紀初由波斯遷往印度西海岸古紮拉特等地後，與迦巴爾失去聯系，至十五世紀中葉後又恢復聯系，十七世紀後，他們在孟買附近形成一個獨特的社會集團，被稱為帕西人。據二十世紀八十年代統計，帕西人約有十萬，大都經營工商業，在印度經濟生活中有重要影響。
阿胡拉·馬茲達（Ahura Mazda）是瑣羅亞斯德教的最高神，又名歐馬茲特（Ormuzd）。阿胡拉·馬茲達在善惡二元論中是代表光明的善神，與代表黑暗的惡神阿裡曼（Ahriman）進行長期的戰鬥，最後獲得勝利。
創世分為七個階段：天空、水、大地、植物、動物、人類、火。為瞭戰鬥，阿胡拉·馬茲達創造瞭世界和人，首先創造瞭火，瑣羅亞斯德的出生是善神阿胡拉·馬茲達勝利的結果，瑣羅亞斯德的精髓每一千年產生一個兒子，他指定第三個兒子為救世主，以徹底肅清魔鬼，使人類進入“光明、公正和真理的王國”。
按該教經典之一《創世紀》，謂宇宙自亙古以來善、惡二神即已存在，中間間隔為虛空，二者相互鬥爭，於是開始瞭創世過程。該教神話把世界歷史分為四個階段，每段三千年，共一萬兩千年：
第一階段（最初的三千）中，阿胡拉·瑪茲達創造精神世界，而無物質形式，皆為原型；
第二階段（三千年至六千年）中，雙方在物質世界戰鬥，安格拉·曼紐殺死瞭原牛，原牛的骨髓產生瞭植物，其“種”被提純後產生益畜，後他又殺死原人伽玉瑪特，其屍體化為金屬，其“種”經提純後保存，四十年後生瞭人類最初的一對男女始祖，其狀如大黃（多年草本植物）一樣，緊密擁抱在一起，並繁衍瞭人類，但他們受惡神之引誘而墮落；
第三階段（六千至九千年）馬茲達與安格拉·曼紐進行瞭激烈鬥爭，互有勝負。在第九千年時，依善神的意志，瑣羅亞斯德誕生，其誕生標志著世界將進入一個新的時期，將宣揚該教，率眾與黑暗作鬥爭，抑止惡神；
第四階段（九千年至一萬兩千年），瑣羅亞斯德教將廣傳世界，繼續鬥爭，為拯救世人，瑣羅亞斯德的第三子將於此階段末降生，成為“義”的化身，即“救主”，他將徹底清除惡魔，取得最後的勝利，引導人類進入光明、正義與真理之國，此亦即該教之最高理想，這些神話後來被其他宗教繼承，如猶太教之救主將降臨、建立理想的千年王國有雷同之處。
該教主張在善與惡的鬥爭中，人們站在哪一方面，具有個人的自由意志，善有善報、惡有惡報，死後之待遇如何，據生前崇拜馬茲達之虔誠程度與個人表現而定，佛教亦繼承瞭此種思想，該教還把人生前的活動分為思想、言論、行動三類，每類中均有善惡兩種，並將其與天堂、地獄相聯系，“行善者得善報，行惡者得惡報”。
從善者將逐步進入天國，首進天堂之善思天，次進善語天，繼進善行天，最後步入光明天，即永恒之天堂。該教還相信靈魂轉世，據說人死後其靈魂在其屍體上停留四天，以檢查其一生之思、言、行，第四日進入裁判之橋，有群狗守護，如其為善者，將有少女迎接，引至天堂之路；如是惡者，迎之者為女鬼，將其引上地獄之途，永受沉淪之苦。這說明該教已出現世界宗教之萌芽，信徒之得救與否非與生俱來，而是取決於信仰及生前之思想、言論、行動。
審判分為兩種：其一是人死之後第三天，由一位名為Daena的女神帶往“裁判之橋”接受審判。Daena為良知之意，審判之後，善人進入天堂，而惡人則進地獄，而善惡混雜的人，則進入第三境地，該地陰暗，沒有快樂，也沒有悲傷。 其二是：所有靈魂在世界末日時都要最後受一次最後審判，人的靈魂可以蕩除罪惡而復活。
瑣羅亞斯德的二元論學說對於以後在波斯和中亞地區流行的摩尼教，中東地區的閃族宗教、猶太教，基督教中的異端諾斯替派，希臘羅馬哲學中的畢達哥拉斯、赫拉克利特等都有過不同程度的影響。
瑣羅亞斯德教的主要經典是《阿維斯陀》（Zent-Avesta），又稱《波斯古經》，是研究波斯宗教之唯一典據，教義概括為神學上的一元論和哲學上的二元論，認為宇宙初期有善惡兩種神，善神為阿胡拉·馬茲達，意思為智慧之主、光明、生命、創造、善行、美德、秩序、真理的化身，惡神為安格拉曼鈕，是黑暗、死亡、破壞、謊言、惡行的化身，最後善神擊敗惡神，成為世界唯一存在的主宰，波斯古經除瞭記述伊朗的宗教神話、贊歌、禮儀、戒律外，還包括其民族起源、歷史、民間傳說、英雄史詩等內容；波斯宗教中對天使、魔鬼的描述以及其末世觀念和末日審判等之說，無疑都對當時的猶太教產生瞭一定的影響，後來更為基督教所繼承。
阿維斯陀之意與印度吠陀相同，乃智識之謂，聖特為註釋之義。聖特語，即波斯古聖語，但此註釋書聖特卻是用帕拉維（Pahlavi）語言寫成，即波斯語，主要記述瑣羅亞斯德的生平以及教義，原有二十一卷，亞歷山大大帝征服波斯後認為，信仰瑣羅亞斯德教的波斯人作戰太勇敢，故毀瑣羅亞斯德教所有經典，所幸存下來的阿維斯陀僅有一卷，而在希臘留有的一部完整二十一卷抄本後來散佚，在波斯薩珊王朝期間，瑣羅亞斯德教復興，這一卷《阿維斯陀》被拼湊、補齊成為二十一卷，但與原來的版本已不可同日而語。
公元三世紀初安息王朝的伏洛奇薛斯一世曾下令重新收集、整理，把口頭流傳的內容用文字記錄下來；薩珊王朝建立後，這項工作又繼續進行，在沙普爾二世執政時期最後完成《阿維斯陀》二十一卷，該經主要記述瑣羅亞斯德的生平和教義。
現有的《阿維斯陀註釋》為九世紀以後用中古波斯的帕拉維語（缽羅婆語）翻譯和寫作，由若幹分散的經典匯集而成，分為六個部分：
一，耶斯那，即祭祀書。祭司向神供獻祭品時所唱的贊歌，是《阿維斯陀》的主體；其中《伽泰》（意譯為《神歌》）是整部經的最古部分，共十七章。它所使用的語言、韻律、格式與《阿維斯陀》其他部分都不一樣，主要是韻文。很多學者認為，它是公元前六世紀上半期或中期，甚至更早的作品，據說《伽泰》是瑣羅亞斯德本人說教的記錄，因此是教徒日常必讀的經文；
二，維斯帕拉特，即眾神書，也稱為小祭祀書，內容是有關對各種守護神等的贊頌；
三，維提吠達特，即驅魔書；
四，耶斯特，即贊頌書，內容是對各種神祇和天使的贊頌；
五，庫爾達，也稱“小阿維特斯陀”，即短的贊歌或祈禱書；
六，其他零星和片斷的頌歌，從內容看該經是波斯古代宗教神話、傳說、歷史等的匯集，有些在瑣羅亞斯德以前就已出現，瑣羅亞斯德教則根據自己的需要加以編纂。
此外還有用帕拉維語、波斯語或印度地方語寫作的經典和歷史文獻：《那斯克》，為《阿維斯陀》提要，成書於九世紀；《宗教行事》，有瑣羅亞斯德教百科全書之稱，闡述該教哲學、道德和教史等，成書於九世紀；《創世記》描述世界的創成、被創造物的性質、善與惡、末世審判等，成書於九或十一世紀，現存有波斯和印度的文本。另外瑣羅亞斯德教徒從波斯遷居印度後用波斯語或其他文字寫作的《伊斯蘭的神學者》及《塞犍傳奇》（現存最早的是一千六百九十二年寫本），敘述瑣羅亞斯德教的分派和向印度次大陸傳播的歷史等。